Cell Rep：哪种遗传改变或能预测患者最大的癌症死亡风险？

面对癌症，肿瘤学家面临着过度治疗和治疗不足的双重流行病，治疗疾病的过程中往往涉及苛刻的化疗和其它会产生广泛副作用的干预措施，因此，临床医生或许会推迟治疗一种看起来无害的肿瘤，而直到其变得威胁到生命时或许治疗就为时已晚了，或者他们可以选择利用一种严格的疗法来治疗不太具有侵袭性的癌症，这样就会对患者产生的害处大于益处。

哪种遗传改变或能预测患者最大的癌症死亡风险？

图片来源：Cell Reports (2022). DOI: 10.1016/j.celrep.2022.110569

近日，一篇发表在国际杂志Cell Reports上题为“Genome-wide identification and analysis of prognostic features in human cancers”的研究报告中，来自耶鲁大学医学院等机构的科学家们通过研究分析了33中不同人类癌症的分子特征，旨在寻找到一种区分无威胁和侵袭性疾病的方法。

研究者Sheltzer表示，这项研究中，我们首次对几十种癌症类型中致命和相对无害的人类癌症之间的遗传差异进行全面的分析和理解；识别出癌症中的预后生物标志物或许能帮助临床医生评估哪些癌症患者最有可能发展为恶性侵袭性的癌症，但尽管研究人员收集了大量的基因组数据来用于癌症研究，但讲这些数据转化为具有可操作性的临床见解或许一直非常困难。

2006年，美国国家癌症研究所和国家人类基因组研究中心开始了一项大规模、多年的称之为“癌症基因组图谱计划”的研究计划，该计划招募了10,884名患有33种不同癌症类型的患者，同时对这些患者机体的肿瘤进行了特殊的分子分析，研究者的分析数据包括肿瘤的基因表达、突变、拷贝数变异、DNA甲基化、microRNA表达和蛋白质表达等。此外，他们还收集了患者临床治疗过程的一些信息（无论其是术后存活的几个月里还是很多年），这项研究中，研究人员将这两部分数据结合在了一起进行分析。

文章中，研究人员评估了是否癌变肿瘤中存在的任何基因组生物标志物与不同患者较短或较长的生存时间有关，同时该研究还产生了一些令人惊讶的结果，比如，癌症研究人员非常感兴趣利用一些来自特定癌症突变的相关数据作为一种潜在的预后生物标志物，他们认为，癌症中携带特定基因突变的患者或许会经历更糟糕的治疗结局，因此就更需要密切监测这些患者，然而本文研究数据却表明，突变或许在癌症中似乎并没有太大的预后意义。

图片来源：https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(22)00313-8?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS2211124722003138%3Fshowall%3Dtrue

相比之下，研究者发现，拷贝数的变异或许具有高度的预后性，且与多种类型癌症患者的治疗结局密切相关，人类机体的大部分细胞都含有23对染色体，在癌症中，拷贝数变异更趋向于在细胞获得或失去染色体时发生，从而就会导致基因的数量增加或减少；未来研究人员将会更加关注基因和染色体中所发生的拷贝数变异，以及其为何会与癌症患者的死亡直接相关。

研究者Sheltzer说道，一个令人惊讶的发现就是，突变或许传达了相对较少的信息，但来自癌症的其它类型的基因组测量，尤其是拷贝数的测定或许就含有大量的预后信息；此外，研究人员还专门建立了一个门户网站，其允许科学家们对其所分析的结果进行分析，他们希望本文研究结果或能帮助临床医生正确识别出并不需要密集治疗的癌症类型，以及需要进行严格干预的危及生命的癌症类型。

本文研究或许有望帮助改善最需要治疗的癌症患者得到及时的治疗。综上，本文研究中，研究人员的分析货位预后生物标志物的分析建立了一种非常丰富的资源库，同时还阐明了患者的生存数据在临床前癌症研究和疗法开发过程中的用途和价值。（生物谷Bioon.com）

原始出处：

Joan C. Smith，Jason M. Sheltzer. Genome-wide identification and analysis of prognostic features in human cancers, Cell Reports (2022). DOI: 10.1016/j.celrep.2022.110569