俄罗斯科学家参与创建基因组数据统一平台
2023-11-27 10:56:06 973阅读 发布地区:大理白族自治州

 来自俄罗斯、美国、土耳其和欧洲的科学家开发了一个Shambhala平台,可将大量基因活性水平的大数据结合起来。该数据库的创建将使科学家能够将不同实验中兼容性较差的数据结合起来。此项成果发表于《分子生物科学前沿》。

  该Shambhala平台可将每个基因表达谱转换为预定义的通用格式。这样一来,所有数据都被合并到一个矩阵中,其中某些部分就可以进行相互比较。该平台既可以协调异构数据,又考虑到了与正在研究中的基因相关的所有关键生物学特征。

  科研人员在六个数据集上测试了该平台的性能,其中包含约6800个肿瘤样本和11100个人体健康组织的基因活性水平信息。测试结果显示,Shambhala在许多参数上都优于其他方法。

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